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The Robin Lab has developed multiple Shiny-based platforms for tumor immunotherapy, drug resistance, and adverse-event analysis, offering users intuitive and ready-to-access data together with powerful visualization tools. Several of these applications have been published in top journals and have since become highly cited articles.
CAMOIP
Link:https://www.camoip.net
DOI:10.1093/bib/bbac129
CAMOIP 是一个强大的免疫治疗预后生物标志物发现与分子机制探索平台。用户可筛选基因突变或表达等生物标志物进行预后分析。它提供表达、泛突变、免疫原性(TMB、NAL、MANTIS score)、免疫浸润及通路富集(GSEA、ssGSEA)分析模块,并将这些功能扩展至所有 TCGA 癌种,深入了解免疫治疗结局及其潜在生物学机制。
CPADS
Link:https://smuonco.shinyapps.io/CPADS/
DOI:10.1093/bib/bbae237
CPADS 是一个基于 Shiny 的网页工具,整合了超过 29,000 个样本、44 种癌种和 288 种药物的表达数据。提供基因差异表达、相关性、通路和药物反应分析等多种方法及丰富的可视化,帮助临床医生和研究者探索泛癌药物敏感性。
OnlineMeta
Link:https://smuonco.shinyapps.io/Onlinemeta/
DOI:10.1016/j.craph.2025.100023
OnlineMeta 提供强大的偏倚风险分析和七种变量类型的 Meta 分析,以及两种类型的网络 Meta 分析。用户提交数据后,平台自动执行分析并生成多种可视化图表。
PESSA
Link:https://smuonco.shinyapps.io/PESSA
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012024
PESSA 是一个开放获取的网页工具,利用通路富集基因集激活作为生物标志物进行预后分析。整合了来自 GEO、TCGA、EGA 和文献的 238 个数据集,涵盖 51 种癌症类型和 13 种生存状态。
HPVTIMER
Link:http://www.hpvtimer.com/
DOI:10.1002/imt2.130
HPVTIMER 是一个综合性在线平台,分析 HPV 相关肿瘤的免疫微环境。整合了来自 GEO 的 65 个转录组数据集,涵盖 8 种 HPV 相关肿瘤类型(2,290 个样本,超过 10,000 个基因)。
THER
Link:https://smuonco.shinyapps.io/THER/
DOI:10.1111/cpr.70053
THER 是一个探索肿瘤缺氧的在线工具。使用来自 GEO 的 63 个缺氧相关转录组数据集,支持基于氧状态的差异表达、表达谱、相关性、富集及药物敏感性分析。
PanCanSurvPlot
Link:https://smuonco.shinyapps.io/PanCanSurvPlot/
DOI:10.1101/2022.12.25.521884
PanCanSurvPlot 是一个基于 Shiny 的网页工具,整合了来自 GEO 和 TCGA 的 215 个肿瘤数据集,涵盖约 100,000 个基因、约 45,000 个样本、51 种癌种和 13 种生存状态。
OralExplorer
Link:https://smuonco.shinyapps.io/OralExplorer/
DOI:10.1186/s12967-024-05019-8
OralExplorer 是一个面向常见口腔疾病的综合生物信息学工具,整合了 35 个数据集和 901 个样本,涵盖 6 种主要疾病类型。
ImmunoCheckDB
Link:https://smuonco.shinyapps.io/ImmunoCheckDB
DOI:10.1002/mef2.70025
ImmunoCheckDB 包含三个核心模块:Meta 分析、网络 Meta 分析和多组学关联分析。帮助用户分析免疫治疗效果并探索其与肿瘤多组学数据的复杂关系。
ARIS
Link:https://smuonco.shinyapps.io/ARIS
ARIS 是一个十年计划项目,旨在构建免疫治疗联合方案设计的综合平台,分为三个阶段展开。
PDMSA
Link:https://smuonco.shinyapps.io/PDMSA/
PDMSA 是一个大规模交互式网页工具,专门用于基于 DNA 甲基化位点的泛癌生存分析与可视化。